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Enregistrement W1968519275 · doi:10.1021/jm020238t

Design of Noncovalent Inhibitors of Human Cathepsin L. From the 96-Residue Proregion to Optimized Tripeptides

2002· article· en· W1968519275 sur OpenAlexaff
Shafinaz F. Chowdhury, J. Sivaraman, Jing Wang, Gopal Devanathan, Paule Lachance, Hongtao Qi, Robert Ménard, J. Lefebvre, Yasuo Konishi, Mirosław Cygler, Traian Sulea, Enrico O. Purisima

Notice bibliographique

RevueJournal of Medicinal Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBone Metabolism and Diseases
Établissements canadiensBiotechnology Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryTripeptideProteasesProtein precursorBiochemistryCathepsinStereochemistryPeptideCathepsin BEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A novel series of noncovalent inhibitors of cathepsin L have been designed to mimic the mode of autoinhibition of procathepsin L. Just like the propeptide, these peptide-based inhibitors have a reverse-binding mode relative to a substrate and span both the S' and S subsites of the enzyme active site. In contrast to previous studies in which even moderate truncation of the full-length propeptide led to rapid reduction in potency, these blocked tripeptide-sized inhibitors maintain nanomolar potency. Moreover, these short peptides show higher selectivity (up to 310-fold) for inhibiting cathepsin L over K versus only 2-fold selectivity of the 96-residue propeptide of cathepsin L. A 1.9 A X-ray crystallographic structure of the complex of cathepsin L with one of the inhibitors confirms the designed reverse-binding mode of the inhibitor as well as its noncovalent nature. Enzymatic analysis also shows the inhibitors to be resistant to hydrolysis at elevated concentrations of the enzyme. The mode of inhibition of these molecules provides a general strategy for inhibiting other cathepsins as well as other proteases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,378

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations75
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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