Using kinomics to delineate signaling pathways: Control of crtc2/torc2 by the ampk family
Notice bibliographique
Résumé
The classical role of AMP-activated protein kinase (AMPK) as an energy status sensor is expanding to include other members of the AMPK family. Recent genetic and cell biological evidence points to a role for MAP/microtubule affinity-regulating kinase 2 (MARK2/EMK/Par1b) in the regulation of metabolic events as well as in the control of CREB-dependent transcription activated by glucose in pancreatic islet beta cells. We have recently developed an in vitro kinase screening platform to identify novel kinase:substrate pairs, the building blocks of signal transduction pathways. Application of this technology led us to identify MARK2 as the kinase that targets a novel glucose-regulated phosphorylation site on Transducer of Regulated CREB Activity 2 (TORC2, referred to as CREB-Regulated Transcriptional Coactivator 2, or CRTC2), a transcriptional coactivator essential for CREB activity in beta cells. We discuss these recent developments and suggest a model whereby members of the AMPK family integrate numerous signals to coordinate energy metabolism and cellular polarity with gene expression to regulate cell function/proliferation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».