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Enregistrement W1968523919 · doi:10.1007/s12192-012-0337-3

Zebrafish HSF4: a novel protein that shares features of both HSF1 and HSF4 of mammals

2012· article· en· W1968523919 sur OpenAlexafffund
Cynthia L. Swan, Tyler G. Evans, Nicole J. Sylvain, Patrick H. Krone

Notice bibliographique

RevueCell Stress and Chaperones · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Saskatchewan
Mots-clésZebrafishHSF1Gene knockdownMorpholinoBiologyHeat shock factorCell biologyHeat shock proteinPhenotypeGeneHsp70Genetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Heat-shock proteins (hsps) have important roles in the development of the eye lens. We previously demonstrated that knockdown of hsp70 gene expression using morpholino antisense technology resulted in an altered lens phenotype in zebrafish embryos. A less severe phenotype was seen with knockdown of heat-shock factor 1 (HSF1), suggesting that, while it likely plays a role in hsp70 regulation during lens formation, other regulatory factors are also involved. Heat-shock factor 4 plays an important role in mammalian lens development, and an expressed sequence tag encoding zebrafish HSF4 has been identified. The deduced amino acid sequence shares structural similarities with mammalian HSF4 including the lack of an HR-C domain. However, the HR-C domain is absent due to a severe C-terminal truncation within zebrafish HSF4 (zHSF4) relative to the mammalian protein. Surprisingly, the amino acid composition of the zHSF4 DNA binding domain shares a greater degree of identity with HSF1 proteins than it does with mammalian HSF4 proteins. Consistent with this, the binding affinity of in vitro synthesized zHSF4 for discontinuous heat-shock response element sequences is more limited, similar to what has been previously observed for HSF1 proteins. Hsf4 mRNA is expressed in zebrafish adult eye tissue but is only observed in developing embryonic tissue at 60 h post-fertilization or later. This, together with the lack of an observable phenotype following morpholino-based antisense knockdown of hsf4, suggests that zHSF4 is unlikely to play a role in regulating early embryonic lens development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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