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Enregistrement W1968528605 · doi:10.2174/1389201043489666

Tracking Cell Signaling Protein Expression and Phosphorylation by Innovative Proteomic Solutions

2004· review· en· W1968528605 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueCurrent Pharmaceutical Biotechnology · 2004
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaKinexus Bioinformatics Corporation (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésProteomicsProtein microarrayAptamerPhosphorylationTarget proteinComputational biologyQuantitative proteomicsProtein Array AnalysisSignal transductionProtein phosphorylationBiologyMolecular biologyDNA microarrayBiochemistryProtein kinase AGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The most challenging and fruitful biomedical research endeavor of this decade will be the mapping of cell signaling systems and establishing their linkages to normal and disease-related processes. Amongst other things, the Human Genome Sequencing Project has greatly facilitated MALDI-TOF mass spectrometry identification of proteins that have been resolved by standard 2D gel electrophoresis. However, the low abundance of protein kinases and other signal transduction proteins has rendered their analyses particularly problematic without some means of purification and enrichment from cell and tissue lysates. Antibodies have been the most specific affinity probes for tracking target proteins, but their variable quality and high cost preclude their deployment in most discovery-based proteomics studies. Current multi-immunoblotting techniques can permit the probing of a single mini-SDS-PAGE gel with 50 or more antibodies at a time to monitor large changes in the expression and phosphorylation states of signaling proteins. The development of new affinity probes to replace antibodies is necessary to drive large scale proteomics studies. Such affinity probes could include short peptide antibody mimetics (PAM's) and oligonucleotide aptamers that when spotted in 2D array formats (e.g. membrane macroarrays, glass microarrays) or presented on specific beads (e.g. Luminex beads) can capture target proteins for their specific enrichment. The bound target proteins can then be detected using reporter antibodies or other specific probes for their quantitation by high throughput systems. These new proteomics methodologies will accelerate assessment of specific protein expression, post-translational modification, protein-protein interactions and protein-drug interactions to provide a more holistic view of cellular operations and how they might be manipulated under pathological circumstances.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,544
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,381
Écart entre enseignants0,321 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle