Diminished levels of the putative tumor suppressor proteins EXT1 and EXT2 in exostosis chondrocytes
Notice bibliographique
Résumé
The EXT family of putative tumor suppressor genes affect endochondral bone growth, and mutations in EXT1 and EXT2 genes cause the autosomal dominant disorder Hereditary Multiple Exostoses (HME). Loss of heterozygosity (LOH) of these genes plays a role in the development of exostoses and chondrosarcomas. In this study, we characterized EXT genes in 11 exostosis chondrocyte strains using LOH and mutational analyses. We also determined subcellular localization and quantitation of EXT1 and EXT2 proteins by immunocytochemistry using antibodies raised against unique peptide epitopes. In an isolated non-HME exostosis, we detected three genetic hits: deletion of one EXT1 gene, a net 21-bp deletion within the other EXT1 gene and a deletion in intron 1 causing loss of gene product. Diminished levels of EXT1 and EXT2 protein were found in 9 (82%) and 5 (45%) exostosis chondrocyte strains, respectively, and 4 (36%) were deficient in levels of both proteins. Although we found mutations in exostosis chondrocytes, mutational analysis alone did not predict all the observed decreases in EXT gene products in exostosis chondrocytes, suggesting additional genetic mutations. Moreover, exostosis chondrocytes exhibit an unusual cellular phenotype characterized by abnormal actin bundles in the cytoplasm. These results suggest that multiple mutational steps are involved in exostosis development and that EXT genes play a role in cell signaling related to chondrocyte cytoskeleton regulation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».