Bordetella pertussisin sporadic and outbreak settings in Alberta, Canada, July 2004 – December 2012
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: ProvLab Alberta provides all laboratory testing for Bordetella pertussis including sporadic cases and outbreak investigations through collaborations with provincial public health partners. We describe B. pertussis activity in Alberta from July 2004 to December 2012. METHODS: Laboratory testing for pertussis was analyzed using interpreted laboratory data that was generated by DIAL, a secure web-based platform. Duplicate specimens from the same individual ≤90 days were excluded to generate a case-based dataset. Immunization status of confirmed pertussis cases from the provincial immunization repository was reviewed. RESULTS: Overall, 7.1% of suspected pertussis cases tested positive with a higher positivity rate in outbreak as compared to sporadic setting. Annual variations in sporadic pertussis cases were observed across the province with higher positivity rates in 2005, 2008, 2009 and 2012. A significantly higher positivity rate was observed in a northern region of Alberta. While the positivity rate in sporadic setting was highest in adolescents aged 10 to <15 years old (14.8%), population-based disease burden was highest in young children <5 years old. Of the 81.6% (n = 1,348) pertussis cases with immunization records, 48.3% were up-to-date with immunization. The pertussis cases that were up-to-date with their immunization were older (median age 12.9 years) as compared to those with incomplete (median age 9.7 years) or no pertussis immunization (median age 3.8 years). CONCLUSIONS: Cyclic pattern of annual pertussis activity with geographic variation was observed in Alberta with no obvious case finding effect from outbreak investigations. The high positivity rates in adolescents suggested an underestimation of disease burden in this age group.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».