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Enregistrement W1968616693 · doi:10.1186/s12917-014-0251-2

Purification of protein C from canine plasma

2014· article· en· W1968616693 sur OpenAlexaff
Valerie M. Wong, Dorothee Bienzle, M. Anthony Hayes, Paul Taylor, R. Darren Wood

Notice bibliographique

RevueBMC Veterinary Research · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood Coagulation and Thrombosis Mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryAmmonium sulfate precipitationProtein GBiochemistryProtein A/GTrypsinIsoelectric pointAffinity chromatographyMolecular biologyFast protein liquid chromatographyGlycosylationZymogenProtein SChromatographyProtein CAntibodySize-exclusion chromatographyEnzymeFusion proteinBiologyRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In order to characterize the functional properties of canine protein C (CnPC), the zymogen needs to be purified from plasma. The goals of this study were (1) to purify protein C from fresh frozen canine plasma by barium chloride and ammonium sulphate precipitation, followed by immunoaffinity chromatography using a monoclonal mouse antibody against human protein C (HPC4) and (2) to characterize this protein's structure. RESULTS: The purified protein contained three glycosylated forms of a heavy chain (~49 kDa) and a glycosylated light chain (~ 25 kDa). Tandem mass spectra of the peptides obtained following trypsin digestion and liquid chromatography identified this protein to be protein C (vitamin K-dependent protein C precursor, gi|62078422) with 100% probability. Three glycosylation sites (Asn139, Asn202, and Asn350) were identified by detection of peptides containing an N-linked glycosylation consensus sequon with a 3-dalton increase in mass following incubation of the protein with PNGase F in 18O-labeled water. Following incubation with Protac (a specific activator of protein C), the heavy chain showed a slight decrease in molecular size and amidolytic activity measured by a synthetic chromogenic substrate containing an amide bond [H-D-(γ-carbobenzoxyl)-lysyl-prolyl-arginine-paranitroanilide diacetate salt]. The amidolytic activity was increased by ~303-fold in the final protein preparation compared to that in plasma. The purified protein showed concentration-dependent anti-factor V and anti-factor VIII activities in canine plasma in coagulometric factor assays. CONCLUSIONS: These studies showed that CnPC could be purified from plasma using HPC4 and that this protein showed amidolytic and anti-coagulant properties upon activation with Protac.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,271
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,226
Tête enseignante GPT0,404
Écart entre enseignants0,178 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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