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Enregistrement W1968680976 · doi:10.3892/br.2015.414

Association of THBS1 rs1478605 T>C in 5′-untranslated regions with the development and progression of gastric cancer

2015· article· en· W1968680976 sur OpenAlexaff
Binbin Hong, Shuqin Chen, Yuanlin Qi, Jinwei Zhu, Jianyin Lin

Notice bibliographique

RevueBiomedical Reports · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAngiogenesis and VEGF in Cancer
Établissements canadiensMinistry of Education and Child Care
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésGenotypeCancerOdds ratioInternal medicineThrombospondin 1OncogeneMedicineMetastasisSingle-nucleotide polymorphismOncologyAngiogenesisGastroenterologyCancer researchBiologyGeneCell cycleGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thrombospondin 1 (THBS1) plays an important role in angiogenesis and tumor progression. The aim of the present study was to investigate the effects of single‑nucleotide polymorphisms (rs1478605 and rs3743125) in the untranslated regions of the THBS1 gene on the development and progression of gastric cancer. In the case‑control study, 275 gastric cancer patients and 275 cancer‑free controls were successfully genotyped using polymerase chain reaction‑restriction fragment length polymorphism. The data demonstrated that THBS1 rs1478605 genotypic distributions significantly differed between the patient and control groups (P=0.005). Carriers of the CC genotype exhibited a decreased risk of developing gastric cancer compared to the carriers of the CT and TT genotypes [adjusted odd ratio (OR), 0.56; 95% confidence interval (CI), 0.39‑0.79; P=0.001]. The CC genotype of rs1478605 was negatively associated with gastric cancer lymph node metastasis (OR, 0.41; 95% CI, 0.23‑0.71; P=0.001) and was associated with a reduced risk of lymph node metastasis in male patients (OR, 0.27; 95% CI, 0.14‑0.52; P<0.001). The THBS1 CT haplotype was associated with a reduced risk of developing gastric cancer (OR, 0.56; 95% CI, 0.33‑0.93; P=0.02). By contrast, no association was observed between THBS1 rs3743125 and the development and progression of gastric cancer. These results suggest that THBS1 rs1478605 represents a potential molecular marker for gastric cancer.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,351
Score d'incertitude au seuil0,139

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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