SOS—A Sample Ordering System for Delivering “Assay-Ready” Compound Plates for Drug Screening
Notice bibliographique
Résumé
Many bottlenecks in drug discovery have been addressed with the advent of new assay and instrument technologies. However, storing and processing chemical compounds for screening remains a challenge for many drug discovery laboratories. Although automated storage and retrieval systems are commercially available for medium to large collections of chemical samples, these samples are usually stored at a central site and are not readily accessible to satellite research labs. Drug discovery relies on the rapid testing of new chemical compounds in relevant biological assays. Therefore, newly synthesized compounds must be readily available in various formats to biologists performing screening assays. Until recently, our compounds were distributed in screw cap vials to assayists who would then manually transfer and dilute each sample in an “assay-ready” compound plate for screening. The vials would then be managed by the individuals in an ad hoc manner. To relieve the assayist from searching for compounds and preparing their own assay-ready compound plates, a newly customized compound storage system with an ordering software application was implemented at our research facility that eliminates these bottlenecks. The system stores and retrieves compounds in 1 mL-mini-tubes or microtiter plates, facilitates compound searching by identifier or structure, orders compounds at varying concentrations in specified wells on 96- or 384-well plates, requests the addition of controls (vehicle or reference compounds), etc. The orders are automatically processed and delivered to the assayist the following day for screening. An overview of our system will demonstrate that we minimize compound waste and ensure compound integrity and availability. (JALA 2004;9:123-7)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».