Neuropilin-1 is a molecular target of the transcription factor E2F1 and is involved in cerebral ischemia–induced neuronal death
Notice bibliographique
Résumé
After cerebral ischemia, neurons must integrate a multitude of both inhibitory and stimulatory molecular cues, generated as a result of cortical damage, into a functional response. More often than not the response is one of growth cone collapse, axonal retraction and cell death. The mechanisms through which a repelled axon may transduce a death signal to the soma and through which the soma may signal axonal retraction/collapse remain largely unknown, however the neuropilin family of receptors for the repellant semaphorins has been implicated in such responses. Our previous studies have shown that the nuclear transcription factor E2F1 pathway plays an important role in modulating neuronal death in response to a wide range of insults such as glutamate toxicity and cerebral ischemia. Using a high density DNA microarray, we identified that the expression of an axonal guidance molecule, neuropilin-1, is regulated by the transcription factor E2F1. Bioinformatics analysis allowed the identification of a putative E2F1 binding site in the promoter region of neuropilin-1. Subsequent electrophoretic mobility gel shift analysis provided evidence to demonstrate that E2F1 protein is indeed physically capable of binding with specificity to the NRP-1 promoter sequence. Moreover, such binding by E2F1 to the promoter sequence increased in mouse brains subjected to focal cerebral ischemia (Fig 1). The increased occupation of E2F1 at the neuropilin-1 promoter sequence correlated with the temporal induction profile of the mRNA level of neuropilin-1, suggesting that E2F1 transcriptionally up-regulated neuropilin-1 during neuronal death following cerebral ischemia. Taken together, these findings support a model in that nuclear death factors contribute to processes which determine the fate of the damaged distal axons by increasing the amounts of receptors expression to axonal repellent guidance cues that may ultimately lead to cell death and failure to regenerate. Blocking this detrimental signal transduction pathway may have potential therapeutic values.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».