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Enregistrement W1968916416 · doi:10.1038/sj.jcbfm.9591524.0500

Neuropilin-1 is a molecular target of the transcription factor E2F1 and is involved in cerebral ischemia–induced neuronal death

2005· article· en· W1968916416 sur OpenAlexaff
Sheng‐Tao Hou, Susan X. Jiang, Melissa Sheldrick, Angele Desbois

Notice bibliographique

RevueJournal of Cerebral Blood Flow & Metabolism · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueAxon Guidance and Neuronal Signaling
Établissements canadiensNational Research Council CanadaInstitute for Biological SciencesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTranscription factorBiologyNeuropilin 1Cell biologyNeuropilinIschemiaNeuroscienceProgrammed cell deathE2F1Cancer researchMedicineGeneticsInternal medicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

After cerebral ischemia, neurons must integrate a multitude of both inhibitory and stimulatory molecular cues, generated as a result of cortical damage, into a functional response. More often than not the response is one of growth cone collapse, axonal retraction and cell death. The mechanisms through which a repelled axon may transduce a death signal to the soma and through which the soma may signal axonal retraction/collapse remain largely unknown, however the neuropilin family of receptors for the repellant semaphorins has been implicated in such responses. Our previous studies have shown that the nuclear transcription factor E2F1 pathway plays an important role in modulating neuronal death in response to a wide range of insults such as glutamate toxicity and cerebral ischemia. Using a high density DNA microarray, we identified that the expression of an axonal guidance molecule, neuropilin-1, is regulated by the transcription factor E2F1. Bioinformatics analysis allowed the identification of a putative E2F1 binding site in the promoter region of neuropilin-1. Subsequent electrophoretic mobility gel shift analysis provided evidence to demonstrate that E2F1 protein is indeed physically capable of binding with specificity to the NRP-1 promoter sequence. Moreover, such binding by E2F1 to the promoter sequence increased in mouse brains subjected to focal cerebral ischemia (Fig 1). The increased occupation of E2F1 at the neuropilin-1 promoter sequence correlated with the temporal induction profile of the mRNA level of neuropilin-1, suggesting that E2F1 transcriptionally up-regulated neuropilin-1 during neuronal death following cerebral ischemia. Taken together, these findings support a model in that nuclear death factors contribute to processes which determine the fate of the damaged distal axons by increasing the amounts of receptors expression to axonal repellent guidance cues that may ultimately lead to cell death and failure to regenerate. Blocking this detrimental signal transduction pathway may have potential therapeutic values.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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