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Enregistrement W1968937021 · doi:10.1016/j.febslet.2006.07.020

Expressed sequence tags from Madagascar periwinkle (<i>Catharanthus roseus</i>)

2006· article· en· W1968937021 sur OpenAlexafffund
Jun Murata, Dorothee Bienzle, Jim Brandle, Christoph W. Sensen, Vincenzo De Luca

Notice bibliographique

RevueFEBS Letters · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueChromosomal and Genetic Variations
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of CalgaryUniversity of GuelphBrock University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaGenome AlbertaGenome Canada
Mots-clésCatharanthus roseusBotanyExpressed sequence tagSequence (biology)BiologyBiochemistryGeneGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Madagascar periwinkle (Catharanthus roseus) is well known to produce the chemotherapeutic anticancer agents, vinblastine and vincristine. In spite of its importance, no expressed sequence tag (EST) analysis of this plant has been reported. Two cDNA libraries were generated from RNA isolated from the base part of young leaves and from root tips to select 9,824 random clones for unidirectional sequencing, to yield 3,327 related sequences and 1,696 singletons by cluster analysis. Putative functions of 3,663 clones were assigned, from 5,023 non-redundant ESTs to establish a resource for transcriptome analysis and gene discovery in this medicinal plant.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,877
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,192
Écart entre enseignants0,179 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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