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Enregistrement W1968976487 · doi:10.4161/epi.5.8.13084

Differential methylation of STOX1 in human placenta

2010· article· en· W1968976487 sur OpenAlex
Marie van Dijk, Sascha Drewlo, Cees B.M. Oudejans

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueEpigenetics · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyMethylationAlleleDNA methylationGenomic imprintingGeneticsCpG sitePlacentaTrophoblastGeneDifferentially methylated regionsGenotypeRegulation of gene expressionGene expressionFetusPregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 10q22 chromosomal region with genomic linkage to pre-eclampsia in Dutch females shows a parent-of-origin effect with maternal transmission of the Y153H susceptibility allele of the STOX1 gene. Although the CpG island within the STOX1 promoter region shows no differential methylation, this study describes the identification of a differentially methylated region (DMR) in intron 1 of the STOX1 gene. Methylation coincides with STOX1 expression, where high methylation leads to reduced expression. In the SGHPL-5 extravillous trophoblast cell line allele-specific expression was observed in a subset of cells. Although no allele-specific expression could be detected in early placenta samples, these samples did show an increase in methylation when they were homozygous for the Y153H susceptibility allele. Allele-specific methylation was observed in column extravillous trophoblast samples with the methylated allele being paternal in origin. We conclude that STOX1 is paternally imprinted, maternally expressed, with the DMR identified in this study showing parental-specific methylation in specific cell-types, hypothesized to occur in villous cytotrophoblasts, and proven in column extravillous trophoblasts originating from the anchoring villus. In other (placental) cells methylation is independent of parental origin, but regulates STOX1 expression with the Y153H genotype directing the level of methylation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,507

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle