Differential methylation of STOX1 in human placenta
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The 10q22 chromosomal region with genomic linkage to pre-eclampsia in Dutch females shows a parent-of-origin effect with maternal transmission of the Y153H susceptibility allele of the STOX1 gene. Although the CpG island within the STOX1 promoter region shows no differential methylation, this study describes the identification of a differentially methylated region (DMR) in intron 1 of the STOX1 gene. Methylation coincides with STOX1 expression, where high methylation leads to reduced expression. In the SGHPL-5 extravillous trophoblast cell line allele-specific expression was observed in a subset of cells. Although no allele-specific expression could be detected in early placenta samples, these samples did show an increase in methylation when they were homozygous for the Y153H susceptibility allele. Allele-specific methylation was observed in column extravillous trophoblast samples with the methylated allele being paternal in origin. We conclude that STOX1 is paternally imprinted, maternally expressed, with the DMR identified in this study showing parental-specific methylation in specific cell-types, hypothesized to occur in villous cytotrophoblasts, and proven in column extravillous trophoblasts originating from the anchoring villus. In other (placental) cells methylation is independent of parental origin, but regulates STOX1 expression with the Y153H genotype directing the level of methylation.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle