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Enregistrement W1969107905 · doi:10.1179/102453311x13025568941808

Single nucleotide polymorphism (SNP) analysis demonstrates a significant association of tumour necrosis factor-alpha (<i>TNFA</i>) with primary immune thrombocytopenia among Caucasian adults

2011· article· en· W1969107905 sur OpenAlexaff
Ameet Sarpatwari, James B. Bussel, Momin Ahmed, Sebhat Erqou, John W. Semple, Adrian C. Newland, Dimitri Bennett, Paul D.P. Pharoah, Drew Provan

Notice bibliographique

RevueHematology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePlatelet Disorders and Treatments
Établissements canadiensSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesWellcome Trust
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismOdds ratioSNPImmunologyAlleleMedicineCase-control studyGenome-wide association studyInterleukin 10Internal medicineGenetic associationCytokineGenotypeImmune systemBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T-helper 1 polarization in patients with primary immune thrombocytopenia (ITP) is well documented. However, the genetic contribution to this imbalance remains unclear. To address this question, we selected six candidate single nucleotide polymorphisms within cytokine or cytokine receptor genes for association testing among Caucasian adults. Patients from the United Kingdom Adult ITP Registry were gender-matched (1:3) with healthy controls from the Wellcome Trust Case Control Consortium. Variants IL10 -819 c>t, TNFA -308 g>a, TGFB1 -509 c>t, IL1A -889 c>t, IL10 -592 c>t, and IL4R q576r were measured in cases and retrieved for controls from the European Genome-phenome Archive. Associations were evaluated using logistic regression models. In total, 206 patients with primary ITP were matched with 618 controls. A significant per allele odds ratio of 1·34 (95% confidence interval, 1·03-1·75; P = 0·03) was observed for TNFA -308 g>a, implicating an increased disease susceptibility among Caucasian carriers of the rare allele.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,923

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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