Identification of Transcriptional Enhancer Factor-4 as a Transcriptional Modulator of CTP:Phosphocholine Cytidylyltransferase α
Notice bibliographique
Résumé
CTP:phosphocholine cytidylyltransferase (CCT) is the rate-limiting and regulated enzyme of mammalian phosphatidylcholine biosynthesis. There are three isoforms, CCTalpha, CCTbeta1, and CCTbeta2. The mouse CCTalpha gene promoter is regulated by an enhancer element (Eb) located between -103 and -82 base pairs (5'-GTTTTCAGGAATGCGGAGGTGG-3') upstream from the transcriptional start site (Bakovic, M., Waite, K., Tang, W., Tabas, I., and Vance, D. E. (1999) Biochim. Biophys. Acta 1436, 147-165). To identify the Eb-binding protein(s), we screened a mouse embryo cDNA library by the yeast one-hybrid system and obtained 19 positive clones. Ten cDNA clones were identified as transcriptional enhancer factor-4 (TEF-4). The TEF-binding consensus sequence, 5'-(A/T)(A/G)(A/G)(A/T)ATG(C/T)(G/A)-3', was identified within the Eb binding region. Gel-shift analysis using radiolabeled Eb fragment as a probe showed that cell extracts from yeast expressing hemagglutinin-tagged TEF-4 caused a marked band retardation that could be prevented with an anti-hemagglutinin antibody. When COS-7 cells were transfected with TEF-4, CCTalpha promoter-luciferase reporter activity and CCTalpha mRNA levels increased. A TEF-4 deletion mutant containing a DNA-binding domain, mTEA(+), stimulated the CCTalpha promoter activity, whereas protein lacking the DNA binding domain, mTEA(-), did not. Unexpectedly, when the ATG core of the TEF-4 binding consensus within the Eb region was mutated, promoter activity was enhanced rather than decreased. Thus, TEF-4 might act as a dual transcriptional modulator as follows: as a suppressor via its direct binding to the Eb element and as an activator via its interactions with the basal transcriptional machinery. These results provide the first evidence that TEF-4 is an important regulator of CCTalpha gene expression.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».