Protein profiles of the Chinese hamster ovary cells in the resting and proliferating stages
Notice bibliographique
Résumé
Identification and characterization of the proteins that regulate the transition from the resting stage (G0) through G1 to S phase of the cell cycle are of central importance to understand the control of cell proliferation and chromosome replication. Unlike in lower organisms, where relatively small numbers of key factors are involved in this process, the factors involved in the same control mechanisms in mammalian systems are much more complex. Furthermore, accumulating lines of evidence now suggest that the nuclear matrix and chromatin organization also play an essential role for the cell cycle control in mammalian cells. To gain a better understanding of the overall dynamics and changes of the protein factors in the context of matrix/chromatin organization, we examined the protein profiles of the Chinese hamster ovary (CHO) cells in different cell cycle compartments. The methods used in this study included subcellular fractionations (cytosol, nuclear extraction, chromatin, and nuclear matrix), two-dimensional polyacrylamide gel electrophoresis (2-D PAGE), silver staining, and immunoblotting. As expected, significant changes of protein profiles were observed when cells entered into proliferating stages from G0. Among approximately 1200 protein spots analyzed by 2-D PAGE, at least 12 showed marked increase or decrease at this transitional period. Further cell-cycle progression from G1 to S phase showed less dramatic changes of overall protein protile. However, the profile of certain proteins showed rather dramatic changes of their subcellular localization during this transitional period. In particular, the levels of proliferating cell nuclear antigen (PCNA) in the nuclear matrix and chromatin dramatically increased in mid-G1 and in the beginning of S phase, respectively, while the overall PCNA level was relatively constant throughout the cell cycle.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».