Identification of quorum sensing‐controlled genes in <i><scp>B</scp>urkholderia ambifaria</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The Burkholderia cepacia complex (Bcc) comprises strains with a virulence potential toward immunocompromised patients as well as plant growth-promoting rhizobacteria (PGPR). Owing to the link between quorum sensing (QS) and virulence, most studies among Bcc species have been directed toward QS of pathogenic bacteria. We have investigated the QS of B. ambifaria, a PGPR only infrequently recovered from patients. The cepI gene, responsible for the synthesis of the main signaling molecule N-octanoylhomoserine lactone (C8 -HSL), was inactivated. Phenotypes of the B. ambifaria cepI mutant we observed, such as increased production of siderophores and decreased proteolytic and antifungal activities, are in agreement with those of other Bcc cepI mutants. The cepI mutant was then used as background strain for a whole-genome transposon-insertion mutagenesis strategy, allowing the identification of 20 QS-controlled genes, corresponding to 17 loci. The main functions identified are linked to antifungal and antimicrobial properties, as we have identified QS-controlled genes implicated in the production of pyrrolnitrin, burkholdines (occidiofungin-like molecules), and enacyloxins. This study provides insights in the QS-regulated functions of a PGPR, which could lead to beneficial potential biotechnological applications.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle