DNA ploidy compared with human papilloma virus testing (Hybrid Capture II) and conventional cervical cytology as a primary screening test for cervical high‐grade lesions and cancer in 1555 patients with biopsy confirmation
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Because 80% of cervical cancers arise in low-resource settings, many inexpensive strategies are being tested. In that spirit, the authors are testing large-scale genomic or DNA ploidy measurements as an inexpensive and semiautomated strategy. METHODS: Patients entered either a screening or diagnostic study of several optical technologies: quantitative cytology, quantitative histopathology, and fluorescence and reflectance spectroscopy using a point probe, a multispectral digital colposcope, or a combination of the two. We calculated sensitivities, specificities, positive and negative predictive values, and their confidence interval testing conventional cytology, Hybrid Capture (HC) II testing, and DNA ploidy measured on the Feulgen-stained quantitative Pap smear. RESULTS: The current investigation reports on 1555 patients for whom colposcopically directed biopsies were read 3 times by study pathologists. The final histopathologic diagnosis was high grade (cervical intraepithelial neoplasia [CIN] 2, CIN 3, carcinoma in situ [CIS], and cancer) in 16% of patients. Using high-grade squamous intraepithelial lesions (SILs) histopathology as the threshold and gold standard, the sensitivity and specificity, respectively, were: 0.47 and 0.96 for conventional cytology, 0.91 and 0.80 for HC II, and 0.59 and 0.93 for DNA ploidy. The positive and negative predictive values (PPV, NPV) for conventional cytology were 0.70 and 0.90, 0.46 and 0.98 for HC II, and 0.63 and 0.92 for DNA ploidy. CONCLUSIONS: DNA ploidy shows comparable sensitivity, specificity, PPV, and NPV values to conventional cytology and HC II. Unlike conventional cytology, DNA ploidy is semiautomated and can be performed in less than 8 hours. Cost effectiveness studies are under way, but in the authors' laboratory DNA ploidy is inexpensive.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,008 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».