MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1969791554 · doi:10.1107/s1600576713029798

Global small-angle X-ray scattering data analysis for multilamellar vesicles: the evolution of the scattering density profile model

2013· article· en· W1969791554 sur OpenAlexaff
Peter Heftberger, Benjamin Kollmitzer, Frederick A. Heberle, Jianjun Pan, Michael Rappolt, Heinz Amenitsch, Norbert Kučerka, John Katsaras, Georg Pabst

Notice bibliographique

RevueJournal of Applied Crystallography · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid Membrane Structure and Behavior
Établissements canadiensBrock University
Organismes subventionnairesOak Ridge National LaboratoryBasic Energy SciencesUT-BattelleAustrian Science FundBattelleLaboratory Directed Research and DevelopmentU.S. Department of Energy
Mots-clésBilayerVesicleScatteringNeutron scatteringDeuteriumSmall-angle neutron scatteringLipid bilayerNeutronSmall-angle scatteringBiological small-angle scatteringCrystallographyMaterials scienceChemistryChemical physicsMolecular physicsOpticsMembranePhysicsNuclear physics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The highly successful scattering density profile (SDP) model, used to jointly analyze small-angle X-ray and neutron scattering data from unilamellar vesicles, has been adapted for use with data from fully hydrated, liquid crystalline multilamellar vesicles (MLVs). Using a genetic algorithm, this new method is capable of providing high-resolution structural information, as well as determining bilayer elastic bending fluctuations from standalone X-ray data. Structural parameters such as bilayer thickness and area per lipid were determined for a series of saturated and unsaturated lipids, as well as binary mixtures with cholesterol. The results are in good agreement with previously reported SDP data, which used both neutron and X-ray data. The inclusion of deuterated and non-deuterated MLV neutron data in the analysis improved the lipid backbone information but did not improve, within experimental error, the structural data regarding bilayer thickness and area per lipid.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Applied CrystallographyMême sujetLipid Membrane Structure and BehaviorTravaux en français237 207