A comparison of genetic variation and structure in the allopolyploid<i>Platanthera huronensis</i>and its diploid progenitors,<i>Platanthera aquilonis</i>and<i>Platanthera dilatata</i>(Orchidaceae)
Notice bibliographique
Résumé
Intersimple sequence repeat (ISSR) markers are used to compare population genetic structure among three widely distributed orchids: Platanthera huronensis (Nuttall) Lindl., an allopolyploid, and its diploid progenitors, Platanthera aquilonis Sheviak, and Platanthera dilatata (Pursh.) Lindl. ex Beck. Platanthera huronensis is very similar to P. dilatata in the level of genetic diversity at both the population and species levels. Populations of P. aquilonis are generally significantly less variable than populations of the other two species, but at the species level, P. aquilonis is more variable than P. dilatata or P. huronensis. Analyses of molecular variance indicated that most of the variation occurs within populations for P. dilatata (ΦST= 0.48, where ΦSTis the combined percentage of variation occurring among groups and among populations) and P. huronensis (ΦST= 0.36), and among populations for P. aquilonis (ΦST= 0.69). Populations in disparate regions are not strongly differentiated in P. aquilonis (7% among regions), while in P. dilatata 27% of the variation observed among populations is due to significant regional differences. Platanthera huronensis might be less genetically variable than expected of a widely distributed allopolyploid species due to a limited number of origins, genetic bottlenecks, and low levels of gene flow. Self-pollination via autogamy is a likely cause of the lower level of variation and greater structure observed in P. aquilonis.Key words: genetic structure, ISSR marker, Orchidaceae, Platanthera, allopolyploid.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».