Replacement of Murine Leukemia Virus Readthrough Mechanism by Human Immunodeficiency Virus Frameshift Allows Synthesis of Viral Proteins and Virus Replication
Notice bibliographique
Résumé
Retroviruses use unusual recoding strategies to synthesize the Gag-Pol polyprotein precursor of viral enzymes. In human immunodeficiency virus, ribosomes translating full-length viral RNA can shift back by 1 nucleotide at a specific site defined by the presence of both a slippery sequence and a downstream stimulatory element made of an extensive secondary structure. This so-called frameshift mechanism could become a target for the development of novel antiviral strategies. A different recoding strategy is used by other retroviruses, such as murine leukemia viruses, to synthesize the Gag-Pol precursor; in this case, a stop codon is suppressed in a readthrough process, again due to the presence of a specific structure adopted by the mRNA. Development of antiframeshift agents will greatly benefit from the availability of a simple animal and virus model. For this purpose, the murine leukemia virus readthrough region was rendered inactive by mutagenesis and the frameshift region of human immunodeficiency virus was inserted to generate a chimeric provirus. This substitution of readthrough by frameshift allows the synthesis of viral proteins, and the chimeric provirus sequence was found to generate infectious viruses. This system could be a most interesting alternative to study ribosomal frameshift in the context of a virus amenable to the use of a simple animal model.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».