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Enregistrement W1970086110 · doi:10.1002/ijc.23979

Characterization of a glycine N‐methyltransferase gene knockout mouse model for hepatocellular carcinoma: Implications of the gender disparity in liver cancer susceptibility

2008· article· en· W1970086110 sur OpenAlexaff
Yi‐Jen Liao, Shih‐Ping Liu, C.-H. Lee, Chia‐Hung Yen, Pei‐Chun Chuang, Chia‐Yen Chen, Ting‐Fen Tsai, Shiu‐Feng Huang, Yan‐Hwa Wu Lee, Yi‐Ming Arthur Chen

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Cancer · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensCAE (Canada)
Organismes subventionnairesNational Yang-Ming UniversityNational Science Council
Mots-clésBiologyCancer researchWnt signaling pathwayLiver cancerCyclin D1Hepatocellular carcinomaDNA methylationCancerHCCSMethyltransferaseMolecular biologyMethylationGene expressionGeneGeneticsCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatocellular carcinoma (HCC) is the fifth common cancer in the world and it mainly occurs in men. Glycine N-methyltransferase (GNMT) participates in one-carbon metabolism and affects DNA methylation by regulating the ratio of S-adenosylmethionine to S-adenosylhomocystine. Previously, we described that the expression of GNMT was diminished in human HCC. Here, we showed that 50% (3/6) male and 100% (7/7) female Gnmt-/- mice developed HCC, and their mean ages of HCC development were 17 and 16.5 months, respectively. In addition, 42.9% (3/7) of female Gnmt-/- mice had hemangioma. Wnt reporter assay demonstrated that Gnmt is a negative regulator for canonical Wnt signaling pathway. Beta-catenin, cyclin D1 and c-Myc, genes related to Wnt pathway, were upregulated in the liver tissues from both 11 weeks and HCC stage of Gnmt-/- mice. Furthermore, global DNA hypomethylation and aberrant expression of DNA methyltransferases 1 and 3b were found in the early and late stages of HCC development. Hierarchical cluster analysis of 6,023 transcripts from microarray data found that gene expression patterns of HCC tumors from male and female Gnmt-/- mice were distinctively different. Real-time PCR confirmed that Gadd45a, Pak1, Mapk3 and Dsup3 genes of mitogen-activated protein kinase (MAPK) pathway were activated in Gnmt-/- mice, especially in the female mice. Therefore, GNMT is a tumor suppressor gene for liver cancer, and it is associated with gender disparity in liver cancer susceptibility.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,056
Score d'incertitude au seuil0,273

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,037
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations82
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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