Arrhenius activation parameters for the loss of neutral nucleobases from deprotonated oligonucleotide anions in the gas phase
Notice bibliographique
Résumé
Arrhenius activation parameters (E(a) and A) for the loss of neutral nucleobase from a series of doubly deprotonated oligodexoynucleotide 10-mers of the type XT(9), T(9)X, and T(5)XT(4), where X = A, C, and G, have been determined using the blackbody infrared radiative dissociation technique. At temperatures of 120 to 190 degrees C, the anions dissociate exclusively by the loss of a neutral nucleobase (XH), followed by cleavage of the sugar 3' C-O bond leading to (a-XH) and w type ions or, in the case of the T(9)X(2-) ions, the loss of H(2)O. The dissociation kinetics and energetics are sensitive to the nature and position of X. Over the temperature range investigated, the kinetics for the loss of AH and GH were similar, but approximately 100 times faster than for the loss of CH. For the loss of AH and GH, the values of E(a) are sensitive to the position of the base. The order of the E(a)s for the loss of XH from the 5' and 3' termini is: C > G > A; while for T(5)XT(4) the order is: C > A > G. The trends in the values of E(a) do not parallel the trend in deprotonation enthalpies or proton affinities of the nucleobases in the gas phase, indicating that the energetic differences do not simply reflect differences in their gas phase acidity or basicity. The pre-exponential factors (A) vary from 10(10) to 10(15) s(-1), depending on the nature and position of X. These results suggest that the reactivity of individual nucleobases is influenced by stabilizing intramolecular interactions.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».