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Enregistrement W1970180253 · doi:10.1371/journal.pone.0005698

NKX2-5 Regulates the Expression of β-Catenin and GATA4 in Ventricular Myocytes

2009· article· en· W1970180253 sur OpenAlexafffund
Ali Riazi, Jun Takeuchi, Lisa K. Hornberger, Syed Hassan Ejaz Zaidi, Fariba Amini, John G. Coles, Benoit G. Bruneau, Glen S. Van Arsdell

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCongenital heart defects research
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesHospital for Sick ChildrenSick Kids Foundation
Mots-clésGATA4MEF2CDownregulation and upregulationMyocyteCell biologyBeta-cateninCateninBiologyLuciferasePromoterWnt signaling pathwayRegulation of gene expressionHeart developmentReporter geneGene expressionMolecular biologyGeneSignal transductionGeneticsTransfectionEmbryonic stem cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The molecular pathway that controls cardiogenesis is temporally and spatially regulated by master transcriptional regulators such as NKX2-5, Isl1, MEF2C, GATA4, and beta-catenin. The interplay between these factors and their downstream targets are not completely understood. Here, we studied regulation of beta-catenin and GATA4 by NKX2-5 in human fetal cardiac myocytes. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Using antisense inhibition we disrupted the expression of NKX2-5 and studied changes in expression of cardiac-associated genes. Down-regulation of NKX2-5 resulted in increased beta-catenin while GATA4 was decreased. We demonstrated that this regulation was conferred by binding of NKX2-5 to specific elements (NKEs) in the promoter region of the beta-catenin and GATA4 genes. Using promoter-luciferase reporter assay combined with mutational analysis of the NKEs we demonstrated that the identified NKX2-5 binding sites were essential for the suppression of beta-catenin, and upregulation of GATA4 by NKX2-5. CONCLUSIONS: This study suggests that NKX2-5 modulates the beta-catenin and GATA4 transcriptional activities in developing human cardiac myocytes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,176

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations52
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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