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Enregistrement W1970294572 · doi:10.1074/jbc.m112.431932

ATP Alone Triggers the Outward Facing Conformation of the Maltose ATP-binding Cassette Transporter

2012· article· en· W1970294572 sur OpenAlexaff
Huan Bao, Franck Duong

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMaltoseATP hydrolysisTransporterATP-binding cassette transporterChemistryConformational changeHydrolysisBiochemistryBiophysicsDimerATPaseBiologyEnzymeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The maltose transporter MalFGK 2 is a study prototype for ABC importers. During catalysis, the MalFG membrane domain alternates between inward and outward facing conformations when the MalK dimer closes and hydrolyzes ATP. Because a rapid ATP hydrolysis depends on MalE and maltose, it has been proposed that closed liganded MalE facilitates the transition to the outward facing conformation. Here we find that, in contrast to the expected, ATP is sufficient for the closure of MalK and for the conversion of MalFG to the outward facing state. The outward facing transporter binds MalE with nanomolar affinity, yet neither MalE nor maltose is necessary or facilitates the transition. Thus, the rapid hydrolysis of ATP observed in the presence of MalE and maltose is not because closed liganded MalE accelerates the formation of the outward facing conformation. These findings have fundamental implications for the description of the transport reaction. Background: The conformational cycle of MalFGK 2 is stimulated by ATP, MalE, and maltose. Results: The transporter outward facing conformation depends on ATP only. Conclusion: MalE and maltose must therefore stimulate the return of the transporter to the inward facing state. Significance: Understanding the dynamics of the transporter is important to interpret the crystal structures.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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