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Enregistrement W1970349128 · doi:10.1136/mp.54.4.259

Absence of CCND1 gene amplification in breast tumours of BRCA1 mutation carriers

2001· article· en· W1970349128 sur OpenAlexaff
S. A. Vaziri

Notice bibliographique

RevueMolecular Pathology · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBRCA gene mutations in cancer
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclin D1Gene duplicationCancer researchBreast cancerCarcinogenesisMutationBiologyPathologyCancerGeneMolecular biologyMedicineGeneticsCell cycle

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIMS: It was recently reported that significantly fewer breast tumours of BRCA1 mutation carriers overexpressed cyclin D1 and HER2 protein than tumours of age matched breast cancer cases unselected for family history. This study aimed to examine the genetic basis of this reduction by determining the frequency of tumours within this cohort showing DNA amplification of these genes. METHODS: Paraffin wax embedded sections of breast tumours from BRCA1 mutation carriers and age, grade, histological type, and tumour size matched non-familial controls that had previously been stained for cyclin D1 and HER2 protein overexpression were analysed for CCND1 and HER2 gene amplification using fluorescence in situ hybridisation. RESULTS: CCND1 amplification was detected in none of the 30 tumours of the BRCA1 mutation carriers and in 19 of 74 tumours of the matched controls. Of those samples previously determined to overexpress the HER2 protein, HER2 amplification was detected in one of three tumours from BRCA1 mutation carriers and in 13 of 17 tumours of the age matched non-familial cases. CONCLUSION: None of the tumours of BRCA1 mutation carriers showed CCND1 amplification and only one tumour showed HER2 amplification. In contrast, a large proportion of cyclin D1 and HER2 overexpression in tumours of non-familial breast cancer cases could be accounted for by amplification of these genes. These data suggest that breast tumorigenesis in BRCA1 mutation carriers occurs by a molecular mechanism distinct from that of age matched non-familial cases.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations44
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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