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Enregistrement W1970350300 · doi:10.4141/a99-086

Genetic analysis of ten sheep breeds using microsatellite markers

2000· article· en· W1970350300 sur OpenAlexaffvenue
A. Farid, Emily L. O’Reilly, Catherine Dollard, Chris R. Kelsey

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Animal Science · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensGovernment of Newfoundland and LabradorNova Scotia Department of Agriculture
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrosatelliteBiologyLoss of heterozygosityBreedAnimal scienceGenetic variationAlleleVeterinary medicineGeneticsMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The genetic variability of 257 sheep from 10 breeds; North Country Cheviot (NCC), Cheviot (CHE), Dorset (DOR), Suffolk (SUF), Scottish Blackface (SBF), Texel (TEX), Romanov (ROM), Finnish Landrace (FIN), Icelandic (ICE) and Red Masai (MAS) was assessed using 10 microsatellite loci. The average number of alleles per locus was 4.3 in ROM, 5.0 in MAS, and spanned a narrow range (5.4 to 6.0) in the other breeds. Estimates of expected heterozygosity (H E ) of the breeds varied within 0.05 point of each other (0.62 in FIN to 0.67 in CHE), except for ROM (0.53) which was lower (P < 0.05) than those of the other breeds, and in MAS (0.57), which was lower (P < 0.05) than those of NCC, CHE and SBF. Estimates of observed heterozygosity (H O ) of the breeds were the lowest in MAS, ROM and SUF (0.50 to 0.53) and the highest in NCC and CHE (0.64 and 0.67). The H E was greater (P < 0.01) than H O only in SUF. The results suggest that there have not been drastic losses of genetic variability in the intensely selected breeds. The low genetic variability of ROM was probably due to a small number of animals imported to North America. The British breeds (NCC, CHE, SUF, DOR, SBF) were genetically close to each other, as were the North European breeds (ROM, ICE, FIN). MAS was remotely related to the British breeds, but it was surprisingly close to the North European breeds. TEX was more closely related to the British breeds than to the North European breeds. More than 90% of 1000 simulated individuals from each breed were assigned to the correct breed, indicating that this panel of markers is useful for the identification of breed membership of individual animals, and could be used to protect the integrity of registered breeds. Key words: Sheep, genetic variability, genetic distance, microsatellites

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,932
Score d'incertitude au seuil0,342

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations39
Publié2000
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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