Characterization of Distinct Tombusviruses that Cause Diseases of Lettuce and Tomato in the Western United States
Notice bibliographique
Résumé
A soilborne disease of lettuce, associated with necrosis and dieback, has been found with increasing frequency in California and Arizona over the last 10 years. An isometric virus, serologically related to Tomato bushy stunt virus (TBSV), was consistently isolated from lettuce plants with these disease symptoms. Back-inoculation to healthy lettuce plants and subsequent reisolation of the virus from symptomatic lettuce leaves suggested that this virus was the causal agent of this disease. A tombusvirus was also associated with a necrosis disease of greenhouse-grown tomatoes in Colorado and New Mexico. Complementary DNA representing the 3' end of viral genomic RNAs recovered from diseased lettuce and tomato plants had identical nucleotide sequences. However, these sequences were divergent (12.2 to 17.1%) from sequences of the previously described strains of TBSV, Petunia asteroid mosaic virus (PAMV), Artichoke mottled crinkle virus, and Carnation Italian ringspot virus. Additional tombusvirus isolates were recovered from diseased lettuce and tomato plants and these were most closely related to the TBSV-cherry strain (synonymous with PAMV) and to Cucumber necrosis virus based on comparison of 3'-end sequences (0.1 to 0.6% and 4.8 to 5.1% divergence, respectively). Western blot analysis revealed that the new tombusvirus isolated from diseased lettuce and tomato plants in the western United States is serologically distinct from previously described tombusvirus species and strains. Based on genomic and serological properties, we propose to classify this virus as a new tombusvirus species and name it Lettuce necrotic stunt virus.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».