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Enregistrement W1970648806 · doi:10.1186/1742-4690-9-s2-p288

Comparison of the depth of vaccine-elicited HIV-1 Env epitope-specific CD8+ T lymphocyte responses

2012· article· en· W1970648806 sur OpenAlexaff
SL Hulot, Bette Korber, Giuseppe Pantaleo, J. Tartaglia, Bertram L. Jacobs, Beatriz Perdiguero, Carmen Gómez, Mariano Estéban, Norman L. Letvin, MS Seaman, Barton F. Haynes, Sampa Santra

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensSanofi (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEpitopeMedicineVirologyImmunologyHuman immunodeficiency virus (HIV)CD8HIV vaccineAntibodyImmune systemVaccine trial

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

One of the major challenges in the development of an effective HIV-1 vaccine is the extraordinary genetic diversity of the virus. Immunizations of nonhuman primates using consensus and mosaic immunogens have been shown to elicit cross-reactive CD8+T lymphocyte responses that increase the depth of epitope recognition. However, one of the limitations of vaccine-induced epitope-specific CD8+T lymphocytes includes lack of protection against diverse strains and emergent forms of HIV-1 due to altered T cell receptor (TCR) affinity for variant peptide:MHC class I complexes. In this study, we immunized a cohort of fifteen Mamu-A*01+ rhesus monkeys with either a 3-valent mosaic Env, group M consensus Env, or single clade B Env vaccine and compared the ability of the CD8+T lymphocyte populations elicited by each immunogen to recognize variants of an HIV-1 envelope epitope sequence p41A (YI9). We identified vaccine-induced CD8+T lymphocytes populations using tetramers constructed with 9 variants of p41A epitope. We assessed the ability of those variant peptides to activate CTL by measuring cytokine production and CD107a expression. We evaluated proliferation using carboxyfluorescein succinimidyl ester. Finally, we investigated the functional avidity of these CD8+T lymphocytes for the variant peptide:Mamu-A*01 complexes using surface plasmon resonance technology. Our data show that Env immunizations can generate cross-reactive CD8+T lymphocytes that recognize 2 of 9 (22%) of the variants of p41A epitope, with higher responses induced by the consensus and the 3-valent mosaic immunogens (variant from clade C and variant from clade A/E) compared to the single clade Env immunogen. Tetramer-binding data also show that CD8+ T lymphocytes from monkeys immunized with mosaic immunogen have a trend of higher binding to majority of the variant peptides tested. This underscores the potential of mosaic immunogens for generating cellular immune responses with greater depth.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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