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Enregistrement W1970712522 · doi:10.1139/o09-170

Structure determination of <i>Streptococcus suis</i> serotype 2 capsular polysaccharide

2010· article· en· W1970712522 sur OpenAlexafffundvenue
Marie‐Rose Van Calsteren, Fleur Gagnon, Sonia Lacouture, Nahuel Fittipaldi, M. Gottschalk

Notice bibliographique

RevueBiochemistry and Cell Biology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueStreptococcal Infections and Treatments
Établissements canadiensInstitut de Technologie AgroalimentaireCegep de Saint Hyacinthe
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésSialic acidStreptococcus agalactiaeStreptococcus suisSerotypeBiochemistryChemistryMicrobiologyStreptococcus pneumoniaeStreptococcusPolysaccharideStreptococcaceaePeptide sequencePeriodateBacteriaBiologyGeneVirulence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The capsular polysaccharide (CPS) of Streptococcus suis serotype 14 was purified, chemically modified, and characterized. Sugar and absolute configuration analyses gave the following CPS composition: D-Gal, 3; D-Glc, 1; D-GlcNAc, 1; D-Neu5Ac, 1. The Sambucus nigra lectin, which recognizes the Neu5Ac(α2-6)Gal/GalNAc sequence, showed binding to the native CPS. Sialic acid was found to be terminal, and the CPS was quantitatively desialylated by mild acid hydrolysis. It was also submitted to periodate oxidation followed by borohydride reduction and Smith degradation. Sugar and methylation analyses, (1)H and (13)C nuclear magnetic resonance, and mass spectrometry of the native CPS or of its specifically modified products allowed to determine the repeating unit sequence: [6)[Neu5Ac(α2-6)Gal(β1-4)GlcNAc(β1-3)]Gal(β1-3)Gal(β1-4)Glc(β1-](n). S. suis serotype 14 CPS has an identical sialic acid-containing side chain as serotype 2 CPS, but differs by the absence of rhamnose in its composition. The same side chain is also present in group B Streptococcus type Ia CPS, except that in the latter sialic acid is 2,3- rather than 2,6-linked to the following galactose. A correlation between the S. suis CPS sequence and genes of the serotype 14 cps locus encoding putative glycosyltransferases and polymerase responsible for the biosynthesis of the repeating unit is proposed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,176
Score d'incertitude au seuil0,346

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations121
Publié2010
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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