Impact of Methodological Choices on Assessments of the Reliability of Fossil Primate Phylogenetic Hypotheses
Notice bibliographique
Résumé
It has been argued in several recent studies that conventional craniodental characters cannot be assumed to be reliable for the purposes of reconstructing primate phylogenetic relationships and that as a consequence little confidence can be invested in published fossil primate phylogenies. Here, we evaluate this claim by revisiting the analyses reported in one of these studies [Collard and Wood, 2000]. Specifically, we investigate whether the use of alternative methodological procedures would have altered their findings. We focus on three key issues: (1) size correction, (2) outgroup composition and (3) non-phylogenetic correlation among characters. Our analyses suggest that the results of Collard and Wood [2000] were not affected by the size correction method they used or by the outgroup they employed. Our analyses also suggest that their results were not affected by their decision to ignore developmental, functional and other non-phylogenetic correlations among the characters in their data sets. Accordingly, our study supports the assertion that conventional craniodental characters cannot be assumed to be reliable for reconstructing primate phylogenetic relationships. This in turn suggests that many published fossil primate phylogenies may be unreliable.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,547 | 0,836 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,003 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,004 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,005 | 0,014 |
| Communication savante | 0,007 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,005 | 0,008 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».