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Enregistrement W1970865922 · doi:10.1074/jbc.m113.498246

Characterization of Intermediate Steps in Amyloid Beta (Aβ) Production under Near-native Conditions

2013· article· en· W1970865922 sur OpenAlexaff
Fredrik Olsson, Staffan Schmidt, Veit Althoff, Lisa Marie Munter, Shaobo Jin, Susanne Rosqvist, Urban Lendahl, Gerd Multhaup, Johan Lundkvist

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesDeutsche Forschungsgemeinschaft
Mots-clésAmyloid precursor proteinChemistryTransmembrane proteinAmyloid (mycology)Amyloid precursor protein secretaseBiochemistryTransmembrane domainMutationBiologyGeneCell biologyAlzheimer's diseaseInternal medicineMedicineReceptorDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Processing of the amyloid precursor protein (APP) by γ-secretase results in generation of Aβ peptides of different lengths ranging from 51 to 30 residues. Accumulation of Aβ and in particular Aβ42 is enhanced by familial Alzheimer disease (FAD) causing mutations in APP and is believed to play a pivotal role. The molecular mechanism underlying normal Aβ production, the impact of FAD mutations on this process and how anti-amyloidogenic γ-secretase modulators (GSMs) cause a selective decrease in Aβ40 and Aβ42 and an increase in shorter Aβ peptides, however, is poorly understood. By using a combined immuno- and LC-MS-based assay we identify several major intermediates, i.e. 3- and 4-peptides that line up head to head across the entire APP transmembrane sequence from Aβ51 to Aβ31/Aβ30 and from Aβ49 to Aβ30/31. FAD APP mutations displayed a relative increase in 3- and 4-peptides from Aβ48 to Aβ38 compared with Aβ49 to Aβ37. These findings correlate with an increase in the Aβ42/40 ratio. GSMs caused a decrease in Aβ40 and Aβ42 and an increase in Aβ37 and Aβ38 paralleled by an increase of the intermediates Aβ40-38 and Aβ42-39. Collectively, these data provide a thorough characterization of all intermediate steps in Aβ production in native cell membranes and provide key mechanistic insights to genetic and pharmacological modulation of Aβ generation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,276 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations136
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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