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Enregistrement W1970966133 · doi:10.1074/jbc.m113.500975

Cooperative Activation of the T-type CaV3.2 Channel

2013· article· en· W1970966133 sur OpenAlexaff
Pierre-Olivier Demers-Giroux, Benoîte Bourdin, Rémy Sauvé, Lucie Parent

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGatingMutantBiophysicsChemistryKineticsHelix (gastropod)Activation energyWild typeHomology modelingDomain (mathematical analysis)CrystallographyPhysicsBiologyBiochemistryGeneMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T-type Ca V 3 channels are important mediators of Ca 2+ entry near the resting membrane potential. Little is known about the molecular mechanisms responsible for channel activation. Homology models based upon the high-resolution structure of bacterial Na V channels predict interaction between the S4-S5 helix of Domain II (IIS4-S5) and the distal S6 pore region of Domain II (IIS6) and Domain III (IIIS6). Functional intra- and inter-domain interactions were investigated with a double mutant cycle analysis. Activation gating and channel kinetics were measured for 47 single mutants and 20 pairs of mutants. Significant coupling energies (ΔΔ G interact ≥ 1.5 kcal mol −1 ) were measured for 4 specific pairs of mutants introduced between IIS4-S5 and IIS6 and between IIS4-S5 and IIIS6. In agreement with the computer based models, Thr-911 in IIS4-S5 was functionally coupled with Ile-1013 in IIS6 during channel activation. The interaction energy was, however, found to be stronger between Val-907 in IIS4-S5 and Ile-1013 in IIS6. In addition Val-907 was significantly coupled with Asn-1548 in IIIS6 but not with Asn-1853 in IVS6. Altogether, our results demonstrate that the S4-S5 and S6 helices from adjacent domains are energetically coupled during the activation of a low voltage-gated T-type Ca V 3 channel. Background: The low activation threshold of T-type Ca V 3.2 channels is central to neuronal rhythmogenesis. Results: The S4-S5 linker of Domain II is functionally coupled with Domains II and III during channel activation. Conclusion: Activation of Ca V 3.2 requires a specific interaction between adjacent domains. Significance: Disrupting this protein interface could be a pharmacological strategy to decrease Ca 2+ influx in neuronal pathologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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