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Enregistrement W1971015258 · doi:10.1242/dev.02302

Multiple epigenetic maintenance factors implicated by the loss of Mll2 in mouse development

2006· article· en· W1971015258 sur OpenAlexaff
Stefan Glaser, Julia Schaft, Sandra Lubitz, Kristina Vintersten, F. van der Hoeven, Katharina R. Tufteland, Rein Aasland, Konstantinos Anastassiadis, Siew‐Lan Ang, A. Francis Stewart

Notice bibliographique

RevueDevelopment · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådEuropean Commission
Mots-clésBiologyEpigeneticsHistoneChromatinGeneticsEpigenetic regulation of neurogenesisRegulation of gene expressionEpigenomicsDNA methylationHistone methyltransferasePhenotypeHistone methylationGeneCell biologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenesis is the process whereby the daughters of a dividing cell retain a chromatin state determined before cell division. The best-studied cases involve the inheritance of heterochromatic chromosomal domains, and little is known about specific gene regulation by epigenetic mechanisms. Recent evidence shows that epigenesis pivots on methylation of nucleosomes at histone 3 lysines 4, 9 or 27. Bioinformatics indicates that mammals have several enzymes for each of these methylations, including at least six histone 3 lysine 4 methyltransferases. To look for evidence of gene-specific epigenetic regulation in mammalian development, we examined one of these six, Mll2, using a multipurpose allele in the mouse to ascertain the loss-of-function phenotype. Loss of Mll2 slowed growth, increased apoptosis and retarded development, leading to embryonic failure before E11.5. Using chimera experiments, we demonstrated that Mll2 is cell-autonomously required. Evidence for gene-specific regulation was also observed. Although Mox1 and Hoxb1 expression patterns were correctly established, they were not maintained in the absence of Mll2, whereas Wnt1 and Otx2 were. The Mll2 loss-of-function phenotype is different from that of its sister gene Mll, and they regulate different Hox complex genes during ES cell differentiation. Therefore, these two closely related epigenetic factors play different roles in development and maintain distinct gene expression patterns. This suggests that other epigenetic factors also regulate particular patterns and that development entails networks of epigenetic specificities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations282
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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