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Enregistrement W1971058703 · doi:10.1371/journal.pone.0051040

Transcriptome Analysis Reveals Markers of Aberrantly Activated Innate Immunity in Vitiligo Lesional and Non-Lesional Skin

2012· article· en· W1971058703 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquemelanin and skin pigmentation
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreCanadian Institutes of Health ResearchAstellas PharmaCanadian Dermatology FoundationMichael Smith Health Research BCChild and Family Research Institute
Mots-clésVitiligoInnate immune systemTranscriptomeImmune systemPathologyBiologyMelanocyteFlow cytometryImmunologyMedicineGene expressionGeneCancer researchMelanomaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Vitiligo is characterized by the death of melanocytes in the skin. This is associated with the presence of T cell infiltrates in the lesional borders. However, at present, there is no detailed and systematic characterization on whether additional cellular or molecular changes are present inside vitiligo lesions. Further, it is unknown if the normal appearing non-lesional skin of vitiligo patients is in fact normal. The purpose of this study is to systematically characterize the molecular and cellular characteristics of the lesional and non-lesional skin of vitiligo patients. METHODS AND MATERIALS: Paired lesional and non-lesional skin biopsies from twenty-three vitiligo patients and normal skin biopsies from sixteen healthy volunteers were obtained with informed consent. The following aspects were analyzed: (1) transcriptome changes present in vitiligo skin using DNA microarrays and qRT-PCR; (2) abnormal cellular infiltrates in vitiligo skin explant cultures using flow cytometry; and (3) distribution of the abnormal cellular infiltrates in vitiligo skin using immunofluorescence microscopy. RESULTS: Compared with normal skin, vitiligo lesional skin contained 17 genes (mostly melanocyte-specific genes) whose expression was decreased or absent. In contrast, the relative expression of 13 genes was up-regulated. The up-regulated genes point to aberrant activity of the innate immune system, especially natural killer cells in vitiligo. Strikingly, the markers of heightened innate immune responses were also found to be up-regulated in the non-lesional skin of vitiligo patients. CONCLUSIONS AND CLINICAL IMPLICATIONS: As the first systematic transcriptome characterization of the skin in vitiligo patients, this study revealed previously unknown molecular markers that strongly suggest aberrant innate immune activation in the microenvironment of vitiligo skin. Since these changes involve both lesional and non-lesional skin, our results suggest that therapies targeting the entire skin surface may improve treatment outcomes. Finally, this study revealed novel mediators that may facilitate future development of vitiligo therapies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,318
Score d'incertitude au seuil0,389

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle