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Enregistrement W1971182858 · doi:10.1089/adt.2009.191

A Fluorescence-Based High-Throughput Screening Assay for the Identification of T-Type Calcium Channel Blockers

2009· article· en· W1971182858 sur OpenAlex
Francesco Belardetti, Elizabeth Tringham, Cyrus Eduljee, Xinpo Jiang, Haiheng Dong, Adam Hendricson, Yoko Shimizu, Diana L. Janke, David Parker, Janette Mezeyova, Afsheen Khawaja, Hassan Pajouhesh, Robert Fraser, Stephen P. Arnerić, Terrance P. Snutch

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAssay and Drug Development Technologies · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreEli Lilly (Canada)Inimex Pharmaceuticals (Canada)Centre for Drug Research and DevelopmentUniversity of British ColumbiaCelator Pharmaceuticals (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHigh-throughput screeningPatch clampGramicidinVoltage-dependent calcium channelChemistryBiophysicsIon channelDrug discoveryCalcium channelChannel blockerMembrane potentialBiologyBiochemistryReceptorCalciumMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

T-type voltage-gated Ca(2+) channels have been implicated in contributing to a broad variety of human disorders, including pain, epilepsy, sleep disturbances, cardiac arrhythmias, and certain types of cancer. However, potent and selective T-type Ca(2+) channel modulators are not yet available for clinical use. This may in part be due to their unique biophysical properties that have delayed the development of high-throughput screening (HTS) assays for identifying blockers. One notable challenge is that at the normal resting membrane potential (V(m)) of cell lines commonly utilized for drug screening purposes, T-type Ca(2+) channels are largely inactivated and thus cannot be supported by typical formats of functional HTS assays to both evoke and quantify the Ca(2+) channel signal. Here we describe a simple method that can successfully support a fluorescence-based functional assay for compounds that modulate T-type Ca(2+)channels. The assay functions by exploiting the pore-forming properties of gramicidin to control the cellular V(m) in advance of T-type Ca(2+) channel activation. Using selected ionic conditions in the presence of gramicidin, T-type Ca(2+) channels are converted from the unavailable, inactivated state to the available, resting state, where they can be subsequently activated by application of extracellular K(+). The fidelity of the assay has been pharmacologically characterized with sample T-type Ca(2+) channel blockers whose potency has been determined by conventional manual patch-clamp techniques. This method has the potential for applications in high-throughput fluorometric imaging plate reader (FLIPR(R), Molecular Devices, Sunnyvale, CA) formats with cell lines expressing either recombinant or endogenous T-type Ca(2+) channels.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,751
Score d'incertitude au seuil0,358

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle