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Enregistrement W1971234121 · doi:10.1128/jb.00311-11

Broad-Spectrum Biofilm Inhibition by Kingella kingae Exopolysaccharide

2011· article· en· W1971234121 sur OpenAlexaff
Meriem Bendaoud, Evgeny Vinogradov, Nataliya V. Balashova, Daniel E. Kadouri, Scott C. Kachlany, Jeffrey B. Kaplan

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBacterial biofilms and quorum sensing
Établissements canadiensNational Research Council Canada
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesAmerican Heart Association
Mots-clésBiofilmMicrobiologyBiologyPolysaccharideGalactanKingella kingaeActinobacillusTeichoic acidBiochemistryCell wallBacteriaPeptidoglycan

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cell-free extracts prepared from Kingella kingae colony biofilms were found to inhibit biofilm formation by Aggregatibacter actinomycetemcomitans, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis, Candida albicans, and K. kingae. The extracts evidently inhibited biofilm formation by modifying the physicochemical properties of the cell surface, the biofilm matrix, and the substrate. Chemical and biochemical analyses indicated that the biofilm inhibition activity in the K. kingae extract was due to polysaccharide. Structural analyses showed that the extract contained two major polysaccharides. One was a linear polysaccharide with the structure →6)-α-d-GlcNAcp-(1→5)-β-d-OclAp-(2→, which was identical to a capsular polysaccharide produced by Actinobacillus pleuropneumoniae serotype 5. The second was a novel linear polysaccharide, designated PAM galactan, with the structure →3)-β-d-Galf-(1→6)-β-d-Galf-(1→. Purified PAM galactan exhibited broad-spectrum biofilm inhibition activity. A cluster of three K. kingae genes encoding UDP-galactopyranose mutase (ugm) and two putative galactofuranosyl transferases was sufficient for the synthesis of PAM galactan in Escherichia coli. PAM galactan is one of a growing number of bacterial polysaccharides that exhibit antibiofilm activity. The biological roles and potential technological applications of these molecules remain unknown.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,657

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations102
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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