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Enregistrement W1971288976 · doi:10.1210/en.2007-0452

Hepatic Gene Expression Changes in Hypothyroid Juvenile Mice: Characterization of a Novel Negative Thyroid-Responsive Element

2007· article· en· W1971288976 sur OpenAlexafffund
Hongyan Dong, Carole L. Yauk, Andrew Williams, Alice Lee, George R. Douglas, Michael G. Wade

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNuclear Receptors and Signaling
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesHealth Canada
Mots-clésEndocrinologyInternal medicineBiologyThyroidThyroid hormone receptor alphaGene expressionGeneNuclear receptorThyroid hormone receptorResponse elementSignal transductionRegulation of gene expressionDNA microarrayTranscription factorGeneticsPromoterMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The molecular mechanisms involved in the response of developing mice to disruptions in maternal thyroid hormone (TH) homeostasis are poorly characterized. We used DNA microarrays to examine a broad spectrum of genes from the livers of mice rendered hypothyroid by treating pregnant mice from gestational d 13 to postnatal d 15 with 6-propyl-2-thiouracil in drinking water. Twenty-four individuals (one male and one female pup from six litters of control or 6-propyl-2-thiouracil treatment groups, respectively) were profiled using Agilent oligonucleotide microarrays. MAANOVA identified 96 differentially expressed genes (false discovery rate adjusted P < 0.1 and fold change > 2 in at least one gender). Of these, 72 genes encode proteins of known function, 15 of which had previously been identified as regulated by TH. Pathway analysis revealed these genes are involved in metabolism, development, cell proliferation, apoptosis, and signal transduction. An immediate-early response gene, Nr4a1 (nuclear receptor subfamily 4, group A, member 1), was up-regulated by 3-fold in hypothyroid juvenile mouse liver; treatment of HepG2 cells with T(3) resulted in down-regulation of Nr4a1. A potential thyroid response element -1218 to -1188 bp upstream of the promoter region of Nr4a1 was identified and demonstrated to bind TH receptor (TR)-alpha and TRbeta. Point mutation or deletion of the sequence containing the potential Nr4a1-thyroid response element in transient gene expression studies resulted in both higher basal expression and loss of T(3) regulatory capacity, suggesting that this site is responsible for the negative regulation of gene expression by TR and TH.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,528

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations27
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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