First Report of Brown Root Rot of Alfalfa Caused by <i>Phoma sclerotioides</i> in Maine, Ontario, and Pennsylvania
Notice bibliographique
Résumé
Brown root rot (BRR), caused by the fungal pathogen Phoma sclerotioides G. Preuss ex Sacc. (synonym Plenodomus meliloti Dearn. & G.B. Sanford), is associated with yield loss of alfalfa (Medicago sativa L.) in regions with severe winters (1). In the spring of 2007, 9 to 69 alfalfa plants were collected from each of five production fields in Maine, 10 fields in Ontario, and nine fields in Pennsylvania. All alfalfa stands existed at least two winters. P. sclerotioides was isolated from alfalfa root and crown lesions from five fields in Maine (Penobscot, Somerset and Waldo counties), seven fields from southwestern (Woodstock and Niagara), south-central (Lindsay and Belleville), and southeastern Ontario (near Ottawa), and four fields in Pennsylvania (Columbia, Crawford, and Jefferson counties; 41.1 to 41.6°N). BRR incidence was 9 to 29% in Maine, 5 to 29% in Ontario, and 8 to 22% in Pennsylvania. In Ontario, some lesions girdled the crown; in three fields in Maine, large pycnidia characteristic of P. sclerotioides were present on alfalfa crowns and overwintered stems. On potato dextrose agar, conidia (5 to 8 × 2 to 3 μm, unicellular, hyaline, and ovoid) and pycnidia (0.33 to 1.15 mm in diameter with multiple beaks) of single-conidium isolates were characteristic of P. sclerotioides (2). Diagnostic PCR (3) of isolates resulted in a single amplicon of expected size (500 bp). The internal transcribed spacer (ITS) 1, 5.8S, and ITS2 of the rDNA were sequenced for 12 representative isolates, and sequences (GenBank Accession Nos. FJ179151 to FJ179162) were 95.5 to 100% identical to P. sclerotioides ATCC isolate 56515 over a 488-bp alignment. Eight months after seeding, potted 'Vernal' alfalfa was inoculated (4), kept at 4°C for 8 weeks, 0 to -2°C for 12 weeks, 4°C for 8 weeks, and 10 to 15°C for 7 weeks. Of 108 plants inoculated with the Maine isolates, 35 developed severe cortical lesions and 16 died. Of 18 plants inoculated with the Ontario isolates, 16 developed severe cortical lesions and eight died. Of 18 plants inoculated with a Pennsylvania isolate, 11 developed severe cortical lesions and five died. Lesions were typical of BRR: light to very dark brown, sometimes with a darker border, and often containing abundant pycnidia. Plant mortality was associated with lesions that girdled the root and crown. Of 18 plants in the control treatment, three developed severe cortical lesions and none died. BRR is common in Alberta, Saskatchewan, and Manitoba, but in eastern Canada it has been reported only in Nova Scotia. To our knowledge, this is the first report of BRR in Maine, Ontario, and Pennsylvania and the southernmost report of BRR in eastern North America. References: (1) B. Berkenkamp et al. Can. J. Plant Sci. 71:211, 1991. (2) G. H. Boerema et al. Persoonia 15:431, 1994. (3) R. C. Larsen et al. Plant Dis. 86:928, 2002. (4) M. J. Wunsch et al. Plant Dis. 91:1293, 2007.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».