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Enregistrement W1971410598 · doi:10.1111/j.1530-0277.2009.00971.x

Ethanol‐Responsive Genes (<i>Crtam, Zbtb16</i>, and <i>Mobp</i>) Located in the Alcohol‐QTL Region of Chromosome 9 Are Associated With Alcohol Preference in Mice

2009· article· en· W1971410598 sur OpenAlexafffund
Julia Weng, Melissa N. Symons, Shiva M. Singh

Notice bibliographique

RevueAlcoholism Clinical and Experimental Research · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeurotransmitter Receptor Influence on Behavior
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyAlleleGeneticsGeneSingle-nucleotide polymorphismMolecular biologyGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Previously, our group identified cytotoxic and regulatory T-cell molecule (Crtam), zinc finger and BTB domain containing 16 (Zbtb16), and myelin-associated oligodendrocytic basic protein (Mobp) as ethanol-responsive genes in the mouse brain by gene expression profiling. In this study, we used a genetic co-segregation analysis to assess the association of Crtam, Zbtb16, and Mobp with the alcohol preference (AP) phenotype in the alcohol-preferring C57BL/6J (B6) and alcohol avoiding DBA/2J (D2) strains of mice. METHODS: Semi-quantitative reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) was used to confirm previous microarray analysis results that Crtam, Zbtb16, and Mobp brain mRNA levels in the B6 and D2 strains are altered by ethanol treatment. The association of the 3 genes with AP was assessed in a F(2) population (n = 427) derived from the reciprocal crosses involving the B6 and D2 strains. Each F(2) individual was assessed for their AP using the 2 bottle choice test and genotyped for Crtam, Zbtb16, and Mobp single nucleotide polymorphisms (SNPs) that differ between B6 and D2 mice. RESULTS: Semi-quantitative RT-PCR analysis confirmed that Crtam, Zbtb16, and Mobp are ethanol-responsive genes. The SNP analyses show that alleles of the 3 genes co-segregate with the AP phenotype in F(2) mice, where individuals homozygous for the B6 allele have higher AP than those homozygous for the D2 allele. Also, the Crtam-Zbtb16 loci that are tightly linked and the Mobp locus act in an additive fashion in determining the relative AP phenotype. CONCLUSION: Our results are consistent with the hypothesis that Crtam, Zbtb16, and Mobp may be involved in AP in mice. The nature of this association remains to be established and may reflect a direct effect of these genes or an indirect effect caused by linked genes on mouse chromosome 9.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,208
Score d'incertitude au seuil0,968

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,275
Tête enseignante GPT0,442
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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