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Enregistrement W1971696110 · doi:10.1242/jeb.053330

Origins of variation in muscle cytochrome <i>c</i> oxidase activity within and between fish species

2011· article· en· W1971696110 sur OpenAlexaff
Katharina Bremer, Christopher D. Moyes

Notice bibliographique

RevueJournal of Experimental Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiquePhysiological and biochemical adaptations
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCytochrome c oxidaseAcclimatizationBass (fish)CentrarchidaeMitochondrionEcologyCell biologyMicropterus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mitochondrial content, central to aerobic metabolism, is thought to be controlled by a few transcriptional master regulators, including nuclear respiratory factor 1 (NRF-1), NRF-2 and peroxisome proliferator-activated receptor-γ coactivator-1α (PGC-1α). Though well studied in mammals, the mechanisms by which these factors control mitochondrial content have been less studied in lower vertebrates. We evaluated the role of these transcriptional regulators in seasonal changes in white muscle cytochrome c oxidase (COX) activity in eight local fish species representing five families: Centrarchidae, Umbridae, Esocidae, Gasterosteidae and Cyprinidae. Amongst centrarchids, COX activity was significantly higher in winter for pumpkinseed (2-fold) and black crappie (1.3-fold) but not bluegill or largemouth bass. In esociforms, winter COX activity was significantly higher in central mudminnow (3.5-fold) but not northern pike. COX activity was significantly higher in winter-acclimatized brook stickleback (2-fold) and northern redbelly dace (3-fold). Though mudminnow COX activity increased in winter, lab acclimation to winter temperatures did not alter COX activity, suggesting a role for non-thermal cues. When mRNA was measured for putative master regulators of mitochondria, there was little evidence for a uniform relationship between COX activity and any of NRF-1, NRF-2α or PGC-1α mRNA levels Collectively, these studies argue against a simple temperature-dependent mitochondrial response ubiquitous in fish, and suggest that pathways which control mitochondrial content in fish may differ in important ways from those of the better studied mammals.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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