Abstract 1106: The tumor immune microenvironment modulates response to chemotherapy in high-grade serous epithelial ovarian cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Resistance to platinum-based chemotherapy remains a major impediment in the treatment of serous epithelial ovarian cancer. Recent studies have drawn attention to the role of the tumor-microenvironment in mediating chemotherapy resistance, in addition to established mechanisms of tumor progression. This project is investigating the role of the tumor inflammatory microenvironment in facilitating intrinsic chemotherapy resistance using a cohort of 36 high-grade serous epithelial ovarian cancer patient tumor samples. Total RNA from forty-eight, HGSEOC tumor tissue samples was subjected to gene expression profiling using NanoString technology. This type of bar-coded expression profiling has proven to be equally efficient to study gene expression as quantitative real time PCR technique. The gene panel consisted of 184 human genes that are differentially expressed in human inflammation and 6 internal reference genes. The cohort comprised 18 sensitive (PFS >18months) and 18 resistant (PFS<6 months) samples. A multiplex cytokine assay using the bioplex system was also performed on serum samples from a subset of this cohort. The results showed significant differences in expression of some inflammatory cytokines in the serum that were concurrent with the observed gene expression differences in the tumor samples. The results are indicative of a cooperative role of a specific inflammatory gene signature within the tumor microenvironment that may augment pathways leading to differential drug response. These studies need further independent validations to derive non-invasive blood-based biomarkers for use in predicting chemotherapy resistance in serous epithelial ovarian cancer. Citation Format: Madhuri Koti, Andrew Edwards, Jeremy A. Squire. The tumor immune microenvironment modulates response to chemotherapy in high-grade serous epithelial ovarian cancer. [abstract]. In: Proceedings of the 105th Annual Meeting of the American Association for Cancer Research; 2014 Apr 5-9; San Diego, CA. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Res 2014;74(19 Suppl):Abstract nr 1106. doi:10.1158/1538-7445.AM2014-1106
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».