Transcription Factor IIS Cooperates with the E3 Ligase UBR5 to Ubiquitinate the CDK9 Subunit of the Positive Transcription Elongation Factor B
Notice bibliographique
Résumé
Elongation of transcription by mammalian RNA polymerase II (RNAPII) is regulated by specific factors, including transcription factor IIS (TFIIS) and positive transcription elongation factor b (P-TEFb). We show that the E3 ubiquitin ligase UBR5 associates with the CDK9 subunit of positive transcription elongation factor b to mediate its polyubiquitination in human cells. TFIIS also binds UBR5 to stimulate CDK9 polyubiquitination. Co-localization of UBR5, CDK9, and TFIIS along specific regions of the γ fibrinogen (γFBG) gene indicates that a ternary complex involving these factors participates in the transcriptional regulation of this gene. In support of this notion, overexpression of TFIIS not only modifies the ubiquitination pattern of CDK9 in vivo but also increases the association of CDK9 with various regions of the γFBG gene. Notably, the TFIIS-mediated increase in CDK9 loading is obtained during both basal and activated transcription of the γFBG gene. This increased CDK9 binding is paralleled by an increase in the recruitment of RNAPII along the γFBG gene and the phosphorylation of the C-terminal domain of the RNAPII largest subunit RPB1 on Ser-2, a known target of CDK9. Together, these results identify UBR5 as a novel E3 ligase that regulates transcription and define an additional function of TFIIS in the regulation of CDK9.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».