TheN-Methyl-d-aspartate Receptor Splice Variant NR1–4 C-terminal Domain
Notice bibliographique
Résumé
The intracellular C-terminal domain of the N-methyl-d-aspartate receptor (NMDAR) subunits 1 (NR1) and 2 (NR2) are important, if not essential, to the process of NMDAR clustering and anchoring at the plasma membrane and the synapse. Eight NR1 splice variants exist, four of which arise from alternative splicing of the C-terminal exon cassettes. Alternative splice variants may display a differential ability to interact with synaptic anchoring proteins, and splicing of C-terminal exon cassettes may alter the mechanism(s) of subcellular localization and targeting. The NR1-4 isoform has a significantly different C-terminal composition than the prototypic NR1-1 isoform. Whereas the NR1-1 C terminus is composed of C0, C1, and C2 exon cassettes, the NR1-4 C terminus is composed of the C0 and C2' cassettes. In the present study, we address the importance of the NR1-4 C-terminal exon cassettes (C0C2') in subcellular localization in differentiated pheochromocytoma (PC12) cells, in organotypic cultures of dorsal root ganglia, and also in heterologous cells. NR1-4-green fluorescent protein chimeras were created with deletion of either C0, C2', or both cassettes to address their importance in subcellular distribution and cell surface expression of the NR1-4 subunit. These experiments demonstrate that the NR1-4 splice variant found predominantly in the spinal cord uses the C0 cassette, to a large degree, to organize the subcellular distribution of this receptor subunit. Although the role of the C2' subunit is less clear, it may be involved in subunit clustering. However, this clustering is not always as efficient as that attributed to C0 alone or to the natural combination of C0C2'. Finally, although an intact C-terminal domain is neither necessary for interaction with the NR2A subunit nor surface expression of the NR1-4 subunit, the C-terminal domain fragment alone blocks surface expression of native NR1-4, in a dominant negative fashion, when the two are coexpressed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».