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Enregistrement W1972039708 · doi:10.1002/ajmg.b.30617

Lithium response and genetic variation in the CREB family of genes

2008· article· en· W1972039708 sur OpenAlexafffund
Firoza Mamdani, Martin Alda, Paul Grof, L. Trevor Young, Guy A. Rouleau, Gustavo Turecki

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part B Neuropsychiatric Genetics · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBipolar Disorder and Treatment
Établissements canadiensUniversité de MontréalSTART ClinicUniversity of British ColumbiaMcGill UniversityDouglas Mental Health University Institute
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismGeneGeneticsHaplotypeSNPBiologyPopulationAlleleMolecular biologyGenotypeMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder (BD) is a severe psychiatric disorder that affects 1% of the population. Recently, there have been many attempts to identify specific genes that are involved in BD; however, the task of finding susceptibility genes is not easy due to the complexity of the disorder. Since lithium (Li) has been used for over 40 years now as an effective prophylactic agent and response to Li treatment seems to be, at least in part, genetically determined, classification according to Li response is a manner through which more homogeneous populations can be obtained for investigation. It has previously been suggested that Li exerts an effect on signal transduction pathways, such as the cyclic adenosine monophosphate (cAMP) pathway. We carried out an association study of BD with CREB1, CREB2 and CREB3 genes, located at ch 2q32.3-q34, 22q13.1 and 9pter-p22.1, respectively. A total of three promoter single nucleotide polymorphisms (SNP), 14 SNPs in the UTR, 6 exonic and 15 intronic SNPs were investigated for their frequency and haplotype distribution in a BD sample of 180 lithium responders and 69 nonresponders and 127 controls using a SNaPshot multiplex reaction from Applied Biosystems, a modified fluorescent single base pair extension procedure. Following correction for multiple testing, our results suggest that the CREB1-1H SNP (G/A change, P < 0.002) and the CREB1-7H SNP (T/C change, P < 0.002) may be associated with BD and/or lithium response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,113
Score d'incertitude au seuil0,637

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations96
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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