Transcription-mediated amplification is more sensitive than conventional PCR-based assays for detecting residual serum HCV RNA at end of treatment
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVE: In patients chronically infected with hepatitis C virus (HCV) undergoing antiviral therapy, sustained virologic response is suggested by viral clearance by end of treatment (EOT). Viral clearance is defined by nondetection of serum HCV RNA, usually by qualitative PCR-based assays with limits of detection ranging from 100 to 1000 copies/ml. However, some individuals relapse after achieving apparent viral clearance by EOT. These individuals may have low levels of viremia not detected by current PCR methods. The aim of this retrospective study was to determine whether the Bayer HCV RNA Qualitative Assay, which employs Transcription Mediated Amplification (TMA) and detects 50 HCV RNA copies/ml, could detect residual serum HCV RNA in patients who achieved apparent viral clearance by EOT and subsequently relapsed. METHODS: Samples were obtained at EOT (wk 24 or 48) and follow-up (wk 24-26 posttreatment) from 97 patients treated for HCV (78 relapsing patients, 19 sustained responders). All samples in which HCV RNA was not detected by PCR were tested in a blinded manner for HCV RNA by the TMA-based assay. RESULTS: HCV RNA was detected by the TMA-based assay in 27 (34.6%) EOT and 76 (97.4%) follow-up samples from relapsing patients, but not in any of the EOT or follow-up samples from sustained responders. CONCLUSION: Residual serum HCV RNA was detected by the TMA-based assay in EOT samples from 34.6% of patients that had achieved apparent viral clearance by PCR. The detection of HCV RNA by the TMA-based assay could help redefine EOT response and assist in the antiviral management of HCV infection.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
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Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».