NMR Structure of a Complex Formed by the Carboxyl-Terminal Domain of Human RAP74 and a Phosphorylated Peptide from the Central Domain of the FCP1 Phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
Recycling of RNA polymerase II (RNAPII) requires dephosphorylation of the C-terminal domain (CTD) of the largest subunit of the polymerase. FCP1 enables the recycling of RNAPII via its CTD-specific phosphatase activity, which is stimulated by the RAP74 subunit of the general transcription factor TFIIF. Both the central (centFCP1) and C-terminal (cterFCP1) domains of FCP1 interact independently and specifically with the C-terminal domain of RAP74 (cterRAP74), suggesting that these interactions mediate the stimulatory effect of TFIIF on the CTD phosphatase activity of FCP1. Phosphorylation of FCP1 by casein kinase 2 on residues in its central (T584) and C-terminal (S942 and S944) domains stimulates its binding to RAP74 and its CTD phosphatase activity. To improve our understanding of the FCP1-RAP74 interactions, we previously determined the NMR structure of a complex formed by human cterRAP74 and cterFCP1. We now present the high-resolution NMR structure and thermodynamic characterization by isothermal titration calorimetry of a complex formed by the same cterRAP74 domain and a phosphorylated peptide from the central domain of human FCP1 (centFCP1-PO(4)). Comparison of the cterFCP1-cterRAP74 and centFCP1-PO(4)-cterRAP74 complexes indicates that centFCP1 and cterFCP1 both utilize hydrophobic and acidic residues to recognize the same groove of RAP74, but there are significant differences in the details of their interactions. These differences point to the adaptability of RAP74 to recognize the two regions of FCP1. Our NMR and thermodynamic studies further elucidate the complex molecular mechanism by which TFIIF and FCP1 cooperate for RNAPII recycling.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».