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Enregistrement W1972274192 · doi:10.1094/pdis-10-11-0853

First Report of Zebra Chip Disease and “<i>Candidatus</i> Liberibacter solanacearum” on Potatoes in Idaho

2011· article· en· W1972274192 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

aboutLe titre ou le résumé porte un signal canadien du lexique géographique.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePhytoplasmas and Hemiptera pathogens
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenBankBiologyAccession number (library science)16S ribosomal RNAStolonBotanySolanum tuberosumHorticultureVeterinary medicineBacteriaGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In September 2011, potato (Solanum tuberosum L.) tubers graded in a packing facility in south-central Idaho were observed with internal discolorations suggestive of zebra chip disease (ZC). Symptoms were observed in 1 to 2% of tubers of cv. Russet Norkotah and included brown spots and streaks especially in and near the vascular tissue. Some tubers also showed a dark and sunken stolon attachment typical of ZC (1). Initially, tissue samples were taken from seven symptomatic tubers and tested by PCR for "Candidatus Liberibacter solanacearum", the bacterium associated with ZC. Primers specific for the 16S rDNA (primers CLipoF [4] and OI2c [3]) and the outer membrane protein (OMB 1482f and 2086r) (2) were used. Six of these samples were positive for the bacterium. The amplified 16S rDNA and OMB products from two symptomatic tubers of cv. Russet Norkotah were cloned and three clones of each were sequenced. The 16S sequences (1,071 bp; GenBank Accession Nos. JN848755 and JN848756) from the two tubers varied by one nucleotide and had 99 to 100% sequence identity to numerous "Ca. L. solanacearum" sequences in GenBank (e.g., Accession Nos. HM246509, FJ957897, and EU935004). Sequences of the two OMB clones (605 bp; GenBank Accession Nos. JN848757 and JN848758) had 97% sequence identity to the two "Ca. L. solanacearum" OMB sequences in GenBank (Accession Nos. CP002371 and FJ914617). Six of eight additional symptomatic field-collected cv. Russet Norkotah tubers corresponding to tubers collected in the packing facility were also positive for "Ca. L. solanacearum" by PCR. Additional severely symptomatic tubers of cvs. Russet Burbank, Yukon Gold, and raw cut French fries of Ranger Russet produced in south-central Idaho were subsequently tested by PCR and were found to be positive for "Ca. L. solanacearum" as well. On the basis of the symptoms, specific PCR amplification with two distinct primer pairs and DNA sequence analysis, zebra chip disease caused by "Ca. L. solanacearum" was determined to be present in Idaho. This disease has caused significant economic damage to potatoes in many regions, including Texas, Mexico, Central America, and New Zealand (1). Idaho is the largest potato-producing state in the United States, with over 150,000 ha planted this year, and therefore, ZC potentially poses a significant risk to agriculture in this state. References: (1) J. M. Crosslin et al. Online publication. doi:10.1094/PHP-2010-0317-01-RV, Plant Health Progress, 2010. (2) J. M. Crosslin et al. Southwest. Entomol. 36:125, 2011. (3) S. Jagoueix et al. Mol. Cell. Probes 10:43, 1996. (4) G. A. Secor. Plant Dis. 93:574, 2009.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,227

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,188
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle