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Enregistrement W1972316730 · doi:10.1186/1753-6561-5-s7-p76

Ectopic expression of C-terminal tubulin variants alters wood composition and structure in Populus

2011· article· en· W1972316730 sur OpenAlexaff
Prashant S. Swamy, Feng Long, Batbayar Nyamdari, Jeng‐Der Chung, Shawn D. Mansfield, Scott A. Harding, Chung‐Jui Tsai

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicrotubuleTubulinLigninMicrofibrilCell biologyBiologyCytoskeletonCell wallSecondary cell wallTransgeneTyrosineBotanyBiochemistryGeneCelluloseCell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cortical microtubules are cytoskeletal components that are relevant to the bioenergy and forest products industry due to their postulated role in orchestrating cellulose microfibril deposition during cell wall formation.The microtubule component proteins α-(TUA) and β-tubulins (TUB) are encoded by multi-gene families with very high overall sequence homology across species.To advance our initial characterization studies (Oakley et al., 2007), we have developed a suite of transgenic Populus that exhibit perturbed TUA to TUB transcript ratios, or that express tubulin PTM mimics.Most of the construct combinations resulted in abnormal organogenesis and vascular development, and failed to produce viable plants.Only three of the combinations led to wholeplant regeneration, and interestingly, all three featured the C-terminal variants.This is significant because the C-terminus is the post-translational modification (PTM) hot-spot in animal tubulins.One of the PTM mimics that we developed lacks a C-terminal tyrosine, thought to be the target of a tyrosine cleavage and re-ligation cycle important for tubulin regulation in animal cells.The transgenic trees appeared morphologically normal, but exhibited a range of epinasty and twisting phenotypes in mature leaves.Bark color was noticeably lighter in the transgenics.Microfibril angle, wood density, lignin content, lignin structure and metabolic profiles were altered in the transgenic wood.The results are consistent with a function of microtubules and microtubule PTMs for plant development and cell wall biogenesis in Populus, and offer novel strategies to manipulation of wood properties.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,578
Score d'incertitude au seuil0,119

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
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Résumé présentoui

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