Investigation of Escherichia coli Dimethyl Sulfoxide Reductase Assembly and Processing in Strains Defective for the sec-Independent Protein Translocation System Membrane Targeting and Translocation
Notice bibliographique
Résumé
Dimethyl sulfoxide reductase is a heterotrimeric enzyme (DmsABC) localized to the cytoplasmic surface of the inner membrane. Targeting of the DmsA and DmsB catalytic subunits to the membrane requires the membrane targeting and translocation (Mtt) system. The DmsAB dimer is a member of a family of extrinsic, cytoplasmic facing membrane subunits that require Mtt in order to assemble on the membrane. We show that the MttA(2), MttB, and presumably MttA(1) but not the MttC proteins are required for targeting DmsAB to the membrane. Unlike other Mtt substrates such as trimethylamine N-oxide reductase, the soluble cytoplasmic DmsAB dimer that accumulates in the mtt deletions is very labile. Deletion of the mttA(2) or mttB genes also prevents anaerobic growth on fumarate even though fumarate reductase does not require Mtt for assembly. This was due to the lethality of membrane insertion of DmsC in the absence of the DmsAB subunits. In the absence of DmsC, DmsAB accumulates in the cytoplasm. A 45-amino acid leader on DmsA is removed during assembly. Processing does not require DmsC but does require Mtt. Translocation of DmsAB to the periplasm is not required for processing. The leader may be cleaved by a novel leader peptidase, or the long DmsA leader may traverse the membrane through the Mtt system resulting in cleavage by the periplasmic leader peptidase I followed by release of DmsA into the cytoplasm.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».