<scp>DNA</scp>barcoding<scp>N</scp>eotropical fishes: recent advances from the<scp>P</scp>ampa<scp>P</scp>lain,<scp>A</scp>rgentina
Notice bibliographique
Résumé
The fish fauna of the Pampa Plain, the southernmost distribution range of many Neotropical species, was barcoded in this study. COI sequences were analysed by means of distance (K2P/NJ) and character-based (ML) models, as well as the Barcode Index Number (BIN). K2P/NJ analysis was able to discriminate among all previously identified species while also revealing the likely occurrence of two cryptic species that were further supported by BIN and ML analyses. On the other hand, both BIN and ML were not able to discriminate between two species of Rineloricaria. Despite the small genetic divergence between A. cf. pampa and A. eigenmanniorum, a tight array of haplotypes was observed for each species in both the distance and character-based methods. Deep intraspecific divergences were detected in Cnesterodon decemmaculatus (5%) and Salminus brasiliensis (6%). For Salminus brasiliensis, these findings were further supported by character-based (ML) evidence and meristic and morphological data. Our results also showed that Pampa Plain representatives of Salminus brasiliensis, Rhamdia quelen, Hoplias malabaricus, Synbranchus marmoratus, Australoheros facetus, Oligosarcus jenynsii and Corydoras paleatus differed by more than 3% from their conspecifics from other parts of South America. Overall, this study was able to highlight the likely occurrence of a cryptic species in Salminus brasiliensis and also illustrate the strong geographical structure in the COI sequence composition of seven fish species from South America.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,004 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,004 | 0,003 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,003 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,005 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».